本郷猛
ショッカーの手により、ホッパー＝仮面ライダー1号に改造された男。
あることをきっかけに洗脳が解け、ショッカーを脱走。
また改造人間に等しく起こっていた拒絶反応（リジェクション）が起きない初めての改造人間。
一文字隼人
本郷を抹殺するためにショッカーの放った刺客。
好きになった女性のためにショッカーを裏切り、
本郷と一緒にショッカーと戦うようになる。
他の改造人間同様、拒絶反応を抱える。
風見四郎
ホッパー・Version 3＝仮面ライダーV3に変身する男。
新鋭IT企業「エクサストリーム」社長。
ナノロボットにより当時の新型（Version 3）改造人間となった。
裏切り者の本郷猛と一文字隼人を抹殺する命を受け、本郷たちと敵対するが、
後にショッカーを裏切り本郷、一文字と行動を共にする。
結城丈二
ショッカーの科学者であり医師である。
ゾル大佐と対立し右腕を失うが
開発中のアタッチメントを自らの体に施し武器とした。
ショッカーの再生のため本郷らと共闘する。
神敬介
仮面ライダーエックス。
ショッカーの改造人間の最新型Version 5．
元傭兵のため格闘技や武器の扱いに精通している。
筑波洋
元航空自衛隊員。
死を偽造されてショッカーに拉致。
神敬介と同じVersion 5．のホッパー型改造人間。
自力で航空可能な仮面ライダー。
沖一也
風研究所の所員。
ショッカーの襲撃により瀕死の重傷を負うと共に右腕を失う。
助命のため後に、神博士、志度博士によって
仮面ライダースーパー1に改造される。
村雨良
風研究所の所員。
ショッカーの襲撃により拉致される。
姉をタイガーロイドの殺害されたことでショッカーを憎んでいる。
助命のために結城丈二によって仮面ライダーZXに改造される。
武田梨奈
ショッカーの科学者であり結城丈二の助手及び恋人。
自ら武器を携えショッカーと戦う。
滝和也
元公安刑事、現FBI捜査官。多方面で本郷達をバックアップ。
神博士
元ショッカーの科学者。神敬介の父親。Ver.5の改造人間の開発者。
志度博士
元ショッカーの科学者。神博士同様、Ver.5の改造人間の開発者。
他に対改造人間用の武器の開発も手掛ける。
谷源次郎
神ステーションの所員。飛行機のパイロット。
天本博士
結城丈二の師であり、ショッカーの総統。
ゾル大佐
元ナチスの軍人であり狼型改造人間。
ショッカーでの実権を握ろうとして策を巡らす。
ショッカー改造人間
・スパイダー ：クモ型の改造人間
・スコーピオン ：サソリ型の改造人間
・クロウ ：カラス型の改造人間
・ツインビー ：ハチ型の改造人間
・バッファロー ：水牛型の改造人間
・タイガーロイド ：トラ型の改造人間
立花 藤兵衛
立花レーシング倶楽部代表。
エンジニア兼メカニックも担当。
本郷、一文字の乗るサイクロンの設計と製作者。